التكاثر اللاجنسي: وهو الذي لا يتضمن اتحاداً نووياً أو اندماجياً بين الخلايا الجنسية ويشمل:
أ) الإنقسام البسيط: وذلك بإنقسام النواة وتكوين حاجز فاصل.
ب) التبرعم: وهو تكوين برعم في أطراف الخلية، ثم تنقسم النواة وتتحرك إلى البرعم ويتكون حاجز ينمو البرعم ويكون خلية جديد.

ج)التجزئة: وهى تتفتت خيوط الفطر الى أجزاء يحتوى كل جزء على خلية كاملة.
د) إنتاج الجراثيم اللاجنسية: أي تكوين الأبواغ وهى أكثرالطرق شيوعًا.

التكاثر الجنسي: ويتضمن إندماج بين الخلايا أو أعضاء جنسية ويتم عن طريق الإندماج الخلوي بين خليتين.

تعتمد الفطريات على التكاثر اللاجنسي أكثر من اعتمادها على التكاثر الجنسي، إذ ينتج عن التكاثر اللاجنسي أفراداً عديدة ويتكرر لعدة مرات على مدى فترات طويلة، بينما يحدث التكاثر الجنسي تحت ظروف خاصة وقد يحدث في بعض الفطريات مرة واحدة كل عام.